TMPGEnc DVD Author 2.0ご使用ありがとうございます。
検証担当です。
ご報告ありがとうございます。
本現象を確認いたしました。
現在「DVD全体のメニュー設定」よりハイライト設定をされた場合、デフォルト色になってしまいます。
現在、この現象を回避するには
「トラック＃（トップ）のメニュー設定」部にて
「このトラックのメニューを全体とは違う設定にする」を
選択していただきまして、こちらの方でハイライトを設定していただきますと
各トラック（トップ）のハイライト色を上書き設定する事が出来ます。
次回バージョンアップにてすぐに修正させていただきますので、ご迷惑をおかけしますが
ハイライト設定は上記方法にて設定を行ってくださいますようお願いします。
これからもTMPGEnc DVD Author 2.0をよろしくお願いします。