DVキャプチャーしたAVファイルの映像部をMTV-1000のファイルコンバーターでM2Vファイル化し、
WAVEで切り出した音声部をBesweetでステレオAC3ファイル化(224Kbps)。オーサリングした後、
DragOnDropCDで焼いてみました。

SONY DVP-NS715pでは正常に再生できるんですが、PioneerDV-535では2秒再生して停止し
てしまいます。

さて、何処に原因があるのは全く解りませんが、報告と言うことで、情報を持っている方が、
いらっしゃれば、教えて下さい。

Besweetはドルビーのライセンス製品でないと思います。
つまり、正式なAC3の音声データになっていないからだと思います。
フリーウェアは自己責任で使ってください。
製品版だったら製造メーカーに責任を押しつけましょう。